История библиотеки началась 17 декабря 1971 года, когда приказом Министерства сельского хозяйства СССР  был создан Сибирский филиал Центральной научной сельскохозяйственной библиотеки Всесоюзной академии сельскохозяйственных наук им. В.И. Ленина (ВАСХНИЛ).

29 декабря 1971 года Библиотека была передана  в ведение Сибирского отделения ВАСХНИЛ и была переименована в ЦНСХБ СО ВАСХНИЛ.

В 1990 году, в связи с преобразованием  ВАСХНИЛ в Российскую академию сельскохозяйственную наук, Библиотека получила новое наименование: ЦНСХБ СО Россельхозакадемии.

Основа фонда была сформирована в первые годы существования библиотеки из обменных фондов ЦНСХБ Россельхозакадемии (в то время ЦНСХБ ВАСХНИЛ, г. Москва), библиотек Российского государственного аграрного университета-МСХА им. К.А. Тимирязева (в то время Московская сельскохозяйственная академия им. К.А. Тимирязева) и Новосибирского государственного аграрного университета (в то время Новосибирский государственный сельскохозяйственный институт).

В 1973 году прошло первое региональное совещание научных сельскохозяйственных библиотек и органов научно-технической информации Сибири и Дальнего Востока, на котором ЦНСХБ  СО ВАСХНИЛ получила статус методического и координационного центра для 120 сельскохозяйственных библиотек региона.

В 1974-1978 годах ЦНСХБ  на своей базе объединила библиотечные фонды научно-исследовательских институтов научного городка СО ВАСХНИЛ (СибНИПТИЖ, СибНИИЭСХ, СибИМЭ, ИЭВСиДВ, СибНИИРС и др.) и создала централизованную систему информационно-библиотечного обслуживания научных сотрудников.

В 1988 году ЦНСХБ СО ВАСХНИЛ переехала в новое специализированное здание. Проект этого здания (четырехэтажный корпус площадью около 10 тыс.м²  и объемом свыше 45 тыс. м³, соединенный переходной галереей с научно-исследовательскими учреждениями) был разработан еще в 1974 году по инициативе первого председателя и организатора Сибирского отделения ВАСХНИЛ академика И.И.Синягина.

В начале 90-х годов Библиотека  училась работать в условиях реформ и перехода к рынку.  Коммерциализация книгоиздания, разрушение существовавшего механизма заказа и приобретения литературы поставили  Библиотеку перед необходимостью искать новые источники комплектования и новые (договорные) формы взаимодействия с издательствами и издающими организациями. Бурные изменения в политической и экономической жизни страны потребовали серьезной редакции систематического каталога Библиотеки и АПУ к нему.

Неудовлетворительное состояние фондов многих публичных и учебных  библиотек привело к появлению  в нашей Библиотеке новых категорий пользователей: пенсионеров, школьников старших классов, безработных, студентов коммерческих колледжей и вузов. Была изменена система обслуживания пользователей Библиотеки. В 1993 году Библиотека на договорной основе стала предоставлять свои услуги организациям и учреждениям, не относящимся к СО Россельхозакадемии.

В 1992 году Библиотека приступила к  работе  по автоматизации библиотечно-информационной технологии. В 1996 году была приобретена  интегрированная библиотечно-информационная система "ИРБИС". В этом же году Библиотека начала выполнять информационные запросы ученых с использованием приобретенной у ЦНСХБ СО Россельхозакадемии документальной базы данных по сельскому хозяйству "АГРОС" на CD-ROMах. В последующие годы Библиотека стала широко использовать в своей работе ресурсы Интернет и, в первую очередь, электронные каталоги ведущих российских и зарубежных библиотек.  С 1999 года Библиотека начинает сама создавать электронные ресурсы: базу данных "Переработка и использование сои", биобиблиографические базы данных ведущих ученых Сибирского отделения Россельхозакадемии и др. В 2001 году при финансовой поддержке ИОО "Открытое общество" (фонд Сороса) ЦНСХБ СО Россельхозакадемии вошла в региональную распределенную корпоративную библиотечную систему и начала работу по созданию электронного каталога. С 2003 года ЦНСХБ СО Россельхозакадемии сотрудничает с Центром ЛИБНЕТ.  В 2004 году в Интернете появился сайт  Библиотеки, на котором имеется бесплатный доступ к ее электронным ресурсам для всех заинтересованных пользователей.  В 2006 году   в ЦНСХБ СО Россельхозакадемии  открыт виртуальный читальный зал для предоставления доступа к полным текстам базы данных "Электронная библиотека диссертаций" Российской государственной библиотеки.

Постановлением Президиума Российской академии сельскохозяйственных наук от 28 декабря 2009 г. Государственное научное учреждение Центральная научная сельскохозяйственная библиотека Сибирского отделения Российской академии сельскохозяйственных наук переименовано в Государственное научное учреждение Сибирская научная сельскохозяйственная библиотека Российской академии сельскохозяйственных наук (ГНУ СибНСХБ Россельхозакадемии), которое является правопреемником ГНУ ЦНСХБ СО Россельхозакадемии. Новое наименование учреждения используется с 26 апреля 2010 г.

На сегодняшний день СибНСХБ Россельхозакадемии располагает значительными информационными ресурсами и насчитывает в своих фондах около 644 тыс. документов. Основная тематика комплектования охватывает сельское и лесное хозяйство, пищевые производства, экономические науки, вопросы охраны окружающей среды, биологические науки, вопросы государства и права, основы современного естествознания.

Важной частью фонда является собрание отечественных периодических изданий, включающее более чем 1200 названий. В фонде имеются журналы  по сельскохозяйственной тематике с 1890 г.: "Вестник общественной ветеринарии", "Вестник животноводства" и др. Текущий репертуар подписки включает более 300 названий отечественных и 20 названий зарубежных периодических изданий.

Библиотека собрала коллекцию редких изданий по сельскому хозяйству, которая на сегодняшний день насчитывает около 2 тыс. документов конца XYIII - начала XIX вв.

В СибНСХБ Россельхозакадемии сформирован обширный фонд продолжающихся изданий отраслевых научно-исследовательских учреждений  Российской Федерации, а также изданий (научные труды, научно-методические рекомендации, научно-технические бюллетени, монографии и др.) научных учреждений Сибирского отделения Россельхозакадемии. С 2000 года в целях наиболее полного комплектования, сохранности и пропаганды изданий научных учреждений СО Россельхозакадемии по распоряжению Президиума СО Россельхозакадемии Библиотека получает обязательный экземпляр всех изданий отделения академии.

Основными читателями СибНСХБ Россельхозакадемии являются: сотрудники научно-исследовательских учреждений СО Россельхозакадемии, СО РАН, департамента сельского хозяйства и продовольственного обеспечения Новосибирской области, преподаватели и студенты Новосибирского аграрного университета, студенты высших учебных заведений г. Новосибирска, учащиеся Малой сельскохозяйственной академии СО Россельхозакадемии, старшеклассники п. Краснообска, сотрудники коммерческих фирм, акционерных обществ, банков, финансовых компаний и других организаций. Общее количество читателей Библиотеки составляет более 5 тыс. человек.

 СибНСХБ Россельхозакадемии предоставляет читателям более 20 наименований библиотечно-библиографических и информационных услуг, выпускает "Информационный бюллетень новых поступлений ЦНСХБ СО Россельхозакадемии" и дайджест прессы "Сельское хозяйство. Сельскохозяйственная наука. Сибирское отделение СО Россельхозакадемии: газетные публикации".

За последние годы Библиотека  издала несколько биобиблиографических и библиографических указателей. 

СибНСХБ Россельхозакадемии участвует в работе региональной корпоративной библиотечной системы, входит в Совет по координации деятельности научных библиотек Сибири и Дальнего Востока, в Ассоциацию научных  сельскохозяйственных библиотек СНГ, в Российскую библиотечную ассоциацию, в Международную ассоциацию специальных библиотек, а также является членом Международной ассоциации специалистов сельскохозяйственной информации. Заключены договоры о сотрудничестве с ГПНТБ СО РАН и с ЦНСХБ Россельхозакадемии (г. Москва).

В дальнейшем  СибНСХБ Россельхозакадемии планирует создание дополнительных автоматизированных рабочих мест для специалистов  и пользователей библиотеки, развитие услуг по электронной доставке документов, совершенствование своего сайта, создание новых и поддержание имеющихся электронных ресурсов.

В настоящее время в Библиотеке работает 21 специалист.